モモの隠し技「スターウインド」
【方法】
①移動キャラをモモにして、巨大グノーシス内部へ行く。
②橋を落として進む場所の近くで、光っているところを調べる。
結果：モモの隠しエーテル「スターウインド」、隠し必殺技「レアハンター」が使えるようになる。
モモの隠し技「スターライト」
【方法】
①移動キャラをモモにして、ネピリムの歌声の第2の塔2Fに行く。
②セーブポイントの右上付近、光っている場所を調べる。
結果：モモの隠しエーテル「スターライト」、隠し必殺技「ラブリーレイ」が使えるようになる。
モモの隠し技「ダークロッド」
【方法】
①グノーシス襲撃後（襲撃中でも可）のクーカイ・ファウンデーションで、移動キャラをモモにし、第26・27市街区の酒場へ行く。
②酒場の隣の宿屋2Fから、屋根づたいに酒場の2Fへ行く。
③隠しボスのミンティアが出現するので、これを倒す。
結果：モモの隠し必殺技「ダークロッド」が使えるようになる。
ロボパーツで強力エーテル技
【方法】
①以下の一覧を参考に、セグメント・アドレスにある宝箱から「ロボパーツを入手する。
②クーカイ・ファウンデーションのロボットアカデミーに、ロボパーツを持っていく。
結果：パーツを渡すごとにシオンのエーテル技が追加され、すべて集めると最強のエーテル技「エルデカイザー」が使用可能になる。
ロボパーツのあるセグメント・アドレスのNo.と場所（対応するデコーダの入手場所）は以下の通り。
●ロボパーツ頭・・・No.1：クーカイ・ファウンデーションの宿屋屋上（キングの倉庫にいるピンク・バグから話を聞いたあと、デュランダルパークエリア展望室で）
●ロボパーツ胴・・・No.2：ドッグコロニーのジャンク屋地下（ネピリムの歌声第2の塔でアスラ27式を倒す）
●ロボパーツ右足・・・No.3：クーカイ・ファウンデーションのクリーニング屋（エンセフェロン内ミルチアの森にあるうーくんの家。うーくんをSキャロットJで誘い出すこと）
●ロボパーツ右腕・・・No.7：ヴォークリンデ艦内、スワガー曹長の正面（スワガー曹長からもらう）
●ロボパーツ左足・・・No.8：エルザＢ2Fの通路（クリーニング店で入手した魚群探知機でビーチの魚から婚約指輪を取り戻し、酒場の女性に渡す）
●ロボパーツ左腕・・・No.9：巨大グノーシス内部の研究棟3F（巨大グノーシス内部、事象変変移機関への道の左下エリアのボスの背後）
Jr.の隠し技「マグナムジョー」
【方法】
①デュランダルで自由行動ができるようになったら、Jr.を移動キャラにする。
②居住区内のショップがある部屋に行き、右側のロッカーを破壊する。
③隠しボスのグレイト・ジョーが出現するので、これを倒す。
結果：Jr.の隠しエーテル「マグナムジョー」、隠し必殺技「魂の狂詩曲」が使えるようになる。
エースパイロットと再戦
【方法】
①U-TIC戦艦をEVSで再探索する。
②マップ東側の小部屋に行くと兵士がいるので、接触して戦闘する。
結果：前回はパイロットだった敵がエースパイロットになっている。
倒すと引き続き巨大機動兵器との戦闘になる。
バトリングでハードモード
【方法】
デュランダル到着後、バトリングで1人プレイを選ぶとき、L2+R2を押しながら決定する。
結果：難易度の高いハードモードがプレイできる。
視点を自由に動かす
【方法】
メインメニューの「キャラクター」でキャラのモデリングを見るとき、2PコントローラのL2かR2を押しながら左スティックを動かす。
結果：カメラの角度を360度自由に動かせる。
1P側でも可能だが、この場合カメラの移動角度に制限がかかる。