セーブデータで全要素出現
【方法】
『ザ・ドキュメント・オブ・メタルギアソリッド２』のセーブデータの入ったメモリーカードを挿し、本作を起動する。
結果：通常ではゲームを進めることで増えていく「MISSIONS」の全キャラ、全モード、全レベルがすべて出現している。
Ｘ雷電でプレイできる
【方法】
①雷電のミッションクリア率を50％にして、雷電（NINJA）を出現させる。
②両方のクリア率を100％にする。
結果：全裸状態の雷電が使用可能になる。
タキシードスネークでプレイできる
【方法】
①スネークのミッションクリア率を50％にして、プリスキンを使用可能にする。
②スネークとプリスキンのミッションクリア率を100％にする。
結果：タキシードを着たスネークが使用可能になる。