相手のドリブルが「後ろ向き」になる
【方法】
試合中、相手チームの選手がドリブルしている間に十字ボタンの上を押し続けます。
結果：相手選手が後ろへ下がりながら進んでいるような見た目になります。
アナウンスを早送りする
【方法】
アナウンスが流れている間に、コントローラーⅠのＢボタンを連打します。
結果：実況のセリフが速く流れ、テンポよく進められます。
キックオフ前に放置すると実況が独り言を始める
【方法】
試合開始のホイッスルの前に、何も操作せずにしばらく待ちます。
結果：実況役のキャラクターが「Ａボタンを押してね」と促したり、居眠りを始めたりします。国内大会と国際Jr.ユース大会で実況役の名前が異なります。
※この項目は1つのサイトの記述に基づいています。
※別の記事にも、キックオフ前に放置すると実況が独り言を始めるという趣旨の記述があります。
岬くんを探さずに東邦高等部戦へ出場させる
【方法】
パスワード入力画面で、次のパスワードを入力します。
わむてぞく ねはほざぐ ちろぞゆるず ふゆきぐぐ ますきわげ ぐよわびこぬ
結果：岬くん探しのアドベンチャーパートをクリアしていなくても、東邦高等部戦に岬くんが出場します。
※パスワードの空白の位置は、掲載サイトによって異なる場合があります。
全日本Jr.ユース対東邦学園中等部の試合を始める
【方法】
パスワード入力画面で、次のパスワードを入力します。
おなねぞつ うかへあご むらちまつめ らむもむひ ろろからぬ きおくぼえた
結果：全日本Jr.ユース対東邦学園中等部の試合が始まります。
「変なチーム」と対戦する
【方法】
パスワード入力画面で、次のパスワードを入力します。
パス：ぶぶぶぶぽ ぽぽぽぽぽ ぽぽぽぽぽぽ ぽぽぽぽぽ ぽぽぽぽぽ ぽぽぽぽぽぽ
マッハー：えのめぎず ぶろのひさ せてめここぶ うふむのべ ぴぴさきお おへそごまび
結果：チーム名の表示が、西ドイツの次に並んでいるデータ上の文字列そのままになった、変わったチームと対戦できます。
※同じ系統の「レベルえ」というパスワードも紹介されていますが、掲載サイトによって文字列に食い違いがあったため、ここでは載せていません。
語呂合わせの「おもしろパスワード」で西ドイツ・東邦と対戦する
【方法】
パスワード入力画面で、次のいずれかを入力します。
西ドイツ戦：きやぷてつ ばさいいい いいいいい いいいいいい いいいいい いいいいいい
東邦戦：ようろつぱ にいきたい なようろつぱ にいきたい なようろつ ぱにいきたい
結果：入力した文面に応じたチームと対戦できます。ひらがなの並びが文章になっていて、「ようろつぱ にいきたい」などの語呂合わせです。
※1つのサイトの記述のみに基づいています。
※「西ドイツ戦」のパスワードは、同じサイトに別の文字列も載っています。
決勝が引き分けのままだと「同点優勝」になる
【方法】
全国中学生サッカー大会の決勝で、延長戦まで戦っても決着がつかない状態にします。
結果：南葛と東邦の同点優勝となり、専用の画面が表示されます。
※1つのサイトの記述のみに基づいています。
優勝後の会話に隠しセリフがある
【方法】
全国中学生サッカー大会の優勝後、会話の中で「ン？」というセリフが出たらＡボタンを押し、続けて十字ボタンの左右を押します。
結果：隠しセリフが表示されます。対象になるのは、同点優勝のとき、南葛が優勝したとき、ユニフォーム交換のとき、さなえさんとの会話です。
※1つのサイトの記述のみに基づいています。
岬くんを見つけないまま終えるとエンディングが変わる
【方法】
岬くん探しのアドベンチャーパートをクリアしないまま最後まで進めます。
結果：岬くんとあづみさんが登場しないエンディングになります。
※1つのサイトの記述のみに基づいています。
日向が「ネオタイガーショット」を覚える
【方法】
日向のレベルを12以上にします。そのうえで、1試合のうちにペナルティエリア内からのタイガーショットを2回、キーパーに止められます。
結果：試合後に、日向がネオタイガーショットを習得します。キーパーに止められやすいのはイタリア戦のヘルナンデスや西ドイツ戦のミューラーなので、イタリア戦で狙う方法が紹介されています。
※1つのサイトの記述のみに基づいています。
翼が一定時間だけ「ドライブタイガー」を使える
【方法】
翼のレベルを14以上にして出場します。1試合のうちに、味方の誰のものでもよいので、必殺シュートを3回キーパーに止められます。
結果：その後の5分間だけ、翼がドライブタイガーを使えるようになります。消費するガッツは250です。
※1つのサイトの記述のみに基づいています。
知っておきたい補足
●この作品は、コマンドを入力して隠し要素を出すタイプの裏技が多くありません。パスワード入力を利用した対戦相手の変更が中心で、あとは仕様やクセを利用した小ネタです。
●ゲームの得点は255点が上限で、超えると0点に戻るという記述が見つかりました（1つのサイトのみ）。
●岬くん探しのアドベンチャーパートでは、調べる場所によって凝ったメッセージが出るほか、ある人物の口を調べると当時のテクモのホットラインの電話番号が表示されるという記述もあります（1つのサイトのみ。現在は使われていない番号です）。
●キーパーには見えない体力のような値が設定されており、シュートを受けるたびに減って、決まると回復するという解析が紹介されています。キーパーがボールを弾いた後に倒れることもあり、倒れている間は得点しやすいとされています（1つのサイトのみ。数値の細部は確認できていません）。
コラム：「ガッツがたりない！！」の元ネタ
作中の合言葉のような「ガッツがたりない！！」は、企画を担当した鶴田道孝さんの話によると、あるプログラマーの口ぐせが元になっているそうです。
そのプログラマーは宮田浩さんで、この作品の開発には加わっていませんでした。ゲームが上手だったため、いろいろなタイトルのデバッグやテストプレイを手伝っていて、その場でこの言葉が出ていたとのことです。
三杉くんは能力が高い一方で、試合の終盤になるとガッツが強制的にゼロになります。これは、原作で心臓に不安を抱えているという設定を、ゲームのルールで表したアイデアとして紹介されています。
また、国際Jr.ユース大会の前に遊べるコマンド入力式のアドベンチャーでは、パリで岬くんを探します。うまくいくと「ゴールデンコンビ」が使えるようになります。